为进一步规范横琴粤澳深度合作区（以下简称合作区）土地增值税征收管理，促进合作区房地产市场平稳健康发展，国家税务总局横琴粤澳深度合作区税务局与横琴粤澳深度合作区城市规划和建设局联合发布了《国家税务总局横琴粤澳深度合作区税务局 横琴粤澳深度合作区城市规划和建设局关于发布横琴粤澳深度合作区2000-2019年土地增值税扣除项目金额标准的公告》（以下简称《公告》），现将《公告》解读如下：

一、《公告》出台背景

《国家税务总局 建设部关于土地增值税征收管理有关问题的通知》（国税发〔1996〕48号公布，国家税务总局公告2018年第31号修改）第二条规定：“各级房地产管理部门......按照有关规定严格核算房地产的开发成本和费用，配合税务部门做好土地增值税扣除项目金额的审查工作，防止由于成本费用不实等原因造成土地增值税的流失”；《国家税务总局广东省税务局土地增值税清算管理规程》第五条规定：“税务机关可参照当地工程造价指标，结合市场因素，确定前期工程费、建筑安装工程费、基础设施费、开发间接费用的土地增值税扣除项目金额标准”。根据以上规定，国家税务总局横琴粤澳深度合作区税务局与横琴粤澳深度合作区城市规划和建设局联合制定了《公告》。

二、《公告》的主要内容

（一）《标准》的适用范围

纳税人办理土地增值税清算时，符合《国家税务总局广东省税务局关于发布<国家税务总局广东省税务局土地增值税清算管理规程>的公告》（国家税务总局广东省税务局公告2019年第5号）第二十七条规定的需参照土地增值税扣除项目金额标准据以计算扣除的情形，税务机关参照《横琴粤澳深度合作区2000-2019年土地增值税扣除项目金额标准》（以下简称《标准》）据以计算扣除。

在土地增值税清算过程中，纳税人符合《国家税务总局广东省税务局关于发布<国家税务总局广东省税务局土地增值税清算管理规程>的公告》（国家税务总局广东省税务局公告2019年第5号）第四十条规定的核定征收条件，税务机关根据第四十一条规定对清算项目进行评估计算时，参照《标准》据以计算核定应纳税额。

（二）《标准》的适用时间

税务机关参照《标准》据以计算土地增值税扣除项目金额时，适用房产工程开工至竣工期间所对应年度的《标准》数值。工程造价核定扣除标准的适用时间以工程竣工验收报告中注明的开工、竣工时间为准。当年完工的项目，采用当年的工程造价指标计算适用扣除标准；对于跨年度的项目，按照所占当年的月份数占总月份数的比例，乘以相应年度的指标加权综合计算适用扣除标准。当开工时间和竣工时间在同一年度的综合指标=当年度指标，举例说明：如果开工时间和竣工时间都在2008年，则综合指标直接取值为2008年的指标；当开工时间和竣工时间在不同一年度的，综合指标=Σ当年度的月份数值÷总月份数值×当年度的综合指标，未满1个月的按1个月计。举例说明：如果开工时间为2007年11月，竣工时间为2009年3月，则综合指标为：综合指标=2÷17×2007年指标+12÷17×2008年指标+3÷17×2009年指标。

（三）争议解决机制

纳税人对税务机关参照《标准》据以计算土地增值税扣除项目金额有异议的，应按《国家税务总局广东省税务局关于发布<国家税务总局广东省税务局土地增值税清算管理规程>的公告》（国家税务总局广东省税务局公告2019年第5号）第十六条第一款第（二）项规定提供说明其合理性的相关佐证材料，经税务机关认定后，予以调整。上述相关佐证材料包括但不限于工程施工图、竣工图、工程量清单、材料苗木清单（总平面乔灌木配置图）等。

（四）《标准》的数据更新

横琴粤澳深度合作区2020年之后的土地增值税扣除项目金额标准，由国家税务总局横琴粤澳深度合作区税务局、横琴粤澳深度合作区住房和城乡建设局联合制定更新，在国家税务总局横琴粤澳深度合作区税务局网站上适时公布。

三、公告生效时间

《公告》自发布之日起30日后施行。《国家税务总局珠海市横琴新区税务局关于执行珠海市土地增值税工程造价扣除标准的公告》（国家税务总局珠海市横琴新区税务局公告2019年第2号）同时废止。