办公室（党委办公室）。负责拟订本系统综合工作制度、年度工作计划；组织和审核重要文稿；负责公文处理、会务管理、信息调研、档案管理、机要保密、来信来访、值班值守、国家安全等工作；组织实施督查督办工作；组织办理人大代表议案、建议和政协委员提案；统筹开展本系统税收宣传、涉税舆情管理和政务公开工作。承办党委文件、会议、督办等有关日常综合性事务。

法制科。负责组织实施依法行政工作；负责涉及多个税种、社会保险费和有关非税收入综合性政策文件会办、起草和落实工作；负责规范性文件合法性审查、合规性评估、备案审查、清理等工作；负责重大执法决定法制审核工作；组织协调重大税收案件审理；组织办理行政复议、行政诉讼等事项；组织办理涉税反补贴案件应对工作；负责公职律师和法律顾问相关工作。

货物和劳务税科。负责组织实施增值税、消费税等的征收管理工作，拟订征收管理具体实施办法；负责相关税种具体业务问题的解释和处理；组织落实相关税种的税收优惠政策；负责增值税发票管理，组织相关信息系统的推广应用及管理；指导相关税种的日常管理、日常检查；参与相关税种的风险管理和纳税辅导、咨询服务、税收法律救济等工作。

所得税科。负责组织实施企业所得税、个人所得税征收管理工作，拟订征收管理具体实施办法；负责企业所得税、个人所得税具体业务问题的解释和处理；组织落实企业所得税、个人所得税优惠政策；组织实施企业所得税的季（月）度预征、汇算清缴等工作；组织实施个人所得税源泉扣缴、自行申报、汇算清缴、事后抽查等工作；指导企业所得税、个人所得税的日常管理、日常检查；参与企业所得税、个人所得税风险管理和纳税辅导、咨询服务、税收法律救济等工作。

财产和行为税科。负责组织实施房产税、城镇土地使用税、土地增值税、契税、城市维护建设税、印花税、资源税、环境保护税、车船税、耕地占用税和烟叶税等征收管理工作，拟订征收管理具体实施办法；负责相关税种具体业务问题的解释和处理；组织落实相关税种的税收优惠政策；指导相关税种的日常管理、日常检查；参与相关税种的风险管理和纳税辅导、咨询服务、税收法律救济等工作。

社会保险费和非税收入科。负责组织实施基本养老保险费、基本医疗保险费、失业保险费、工伤保险费、生育保险费等社会保险费以及文化事业建设费、教育费附加和地方教育附加等有关非税收入的征收管理工作，研究制定具体实施办法；指导社会保险费和有关非税收入的日常征管、日常检查工作；参与有关社会保险费和非税收入征收的政策辅导、咨询服务、法律救济等工作。

收入核算科。负责研究拟订本系统税收、社会保险费和有关非税收入规划，参与拟订税收、社会保险费和有关非税收入预算目标并依法组织实施；负责拟订出口退（免）税年度安排，组织落实免抵调库年度安排；负责统筹协调组织收入工作，开展收入预测分析、预警分析和收入质量管理；负责重点税源监控、企业税收资料调查工作；组织落实会统核算、缴库退库、票证管理等制度，实施会计监督。

征收管理科。负责组织落实综合性税收征管法律、法规、规章及规范性文件，拟订具体操作办法；组织实施税务登记、纳税申报、普通发票管理等日常征管工作；负责征管质量监控评价；负责组织落实信息化规划、方案和制度，实施本系统信息化建设、考核评价和验收工作；负责落实税务行业标准和业务需求管理；负责信息化立项和预算管理。

国际税收管理科。组织实施国家（地区）间税收条约（安排）；负责非居民所得、居民境外所得税收管理等跨境税收管理工作；组织实施反避税工作，参与国际税收有关的风险管理；组织实施税收服务“一带一路”建设；组织实施国际税收征管协作；参与国际交流合作和对外技术援助；负责外事管理等工作。

税收经济分析科。负责贯彻落实税收经济分析工作制度，拟订具体实施办法；参与建立并落实税收经济分析指标体系；运用税收数据对本地区经济运行情况开展动态监控分析；开展地区重大经济发展战略实施情况专题分析和本地区与同类型地区的比较分析；组织开展税收政策效应分析，跟踪评估减免税等政策实施效果；负责统筹和指导本系统税收经济分析工作。

财务管理科。负责贯彻落实本系统预决算管理、基建管理、会计核算管理、财务内控管理和政府采购、资产管理等规章、制度，拟订具体实施办法；审核汇编部门预算、决算，组织实施部门决算执行和公开工作；组织实施会计核算、会计基础规范工作；组织实施国库集中收付工作，办理具体收付事项；负责管理机关财务；拟订年度采购计划，办理具体采购事项；负责资产的购置、处置和使用管理等工作；承担税务着装管理工作；组织实施基建项目管理。

督察内审科。负责本系统内部控制工作的组织、管理和监督；组织实施税收执法督察，开展对社会保险费和有关非税收入法律、法规、规章及规范性文件执行情况的监督检查；组织实施预算执行、基本建设、政府采购等内部财务审计和领导干部经济责任审计；组织实施本系统税收执法责任制工作；督促落实督察审计发现问题的整改工作；协调配合外部监督和上级监督，统筹协调内部监督检查工作；参与实施“一案双查”工作。

组织人事科。负责组织落实干部人事制度及税务人才队伍建设规划，拟订具体实施方案；承担人事、机构编制、公务员管理、干部考核等工作；承担工资、人事档案、专业技术职务管理等工作；承担下一级领导班子及领导干部和后备干部的管理、监督等工作；监督检查干部人事规章制度执行情况；办理出国政审事项。负责拟订并组织实施干部培训、学历教育管理制度、工作规划、年度计划；组织开展培训质量考核与评估；承办教育培训项目的开发与管理；承担教育培训经费管理工作；指导、检查本系统教育培训工作；组织落实扶贫工作。指导系统党的组织建设、党员队伍建设等工作。

考核考评科。负责贯彻落实绩效管理和数字人事工作发展规划、制度规范，拟订具体实施办法；分解落实上级下达的考评指标，拟订本局机关和下一级税务机关年度绩效计划及考评指标，组织实施绩效考评工作；组织开展数字人事推行工作，负责数字人事日常管理；开展其他考核考评工作。

党建工作科。协助市税务局党委落实全面从严治党主体责任；督促系统内各级党组织落实管党治党责任，统筹和指导系统党群工作，宣传和执行党的路线方针政策；统筹本系统思想政治建设、意识形态建设、税务文化建设、精神文明建设和统战工作；组织和指导系统巡察工作。

机关党委。组织实施机关党建和党风廉政建设工作；统筹负责机关党员教育、管理、监督和服务工作；组织开展机关思想政治工作和精神文明建设；承担机关统战工作；协调机关工会、共青团、妇委会开展机关群团工作。

老干部科。负责组织落实有关老干部工作的方针政策和工作部署，拟订具体实施办法；承担加强离退休党员干部日常管理和基层党组织建设等任务；负责机关老干部的服务和管理工作，指导本系统老干部工作。

根据有关规定，设置党委纪检组，名称为“中共国家税务总局珠海市税务局委员会纪律检查组”。负责机关和派出机构党的纪律检查工作，指导系统党的纪律检查工作。