办公室（党委办公室）。承担机关日常运转、后勤事务管理、保障和服务工作，承担文秘、信息、政务公开、会务、信访、机要保密、档案、督查督办等工作；组织实施绩效管理工作。

法制股。组织实施依法行政工作；负责涉及多个税种、社会保险费和非税收入综合性政策文件落实工作；承担规范性文件合法性审查、合规性评估、备案审查、清理等工作；承担执法决定法制审核工作；组织协调税收案件审理；承担税务行政复议、行政诉讼等工作；负责落实公职律师和法律顾问相关工作；贯彻落实税收执法督察、执法责任制和内控机制建设工作；督促落实督察审计发现问题的整改工作；协调配合外部监督和上级监督，统筹协调内部监督检查工作。

税政一股。组织实施增值税、消费税、车辆购置税等税种征收管理工作；组织落实相关税种的税收优惠政策；对相关税种具体业务问题进行解释和处理。

税政二股。组织实施企业所得税、个人所得税、土地增值税、契税、城市维护建设税、印花税、资源税、环境保护税、车船税、耕地占用税和烟叶税等税种征收管理工作；组织落实相关税种的税收优惠政策；对相关税种具体业务问题进行解释和处理。

社会保险费和非税收入股。组织实施基本养老保险费、基本医疗保险费、失业保险费、工伤保险费、生育保险费等社会保险费以及文化事业建设费、教育费附加和地方教育附加等有关非税收入的征收管理工作。

收入核算股。组织实施税收、社会保险费和有关非税收入的中长期规划；拟订出口退（免）税年度安排，组织实施免抵调库年度安排；组织实施税收收入的预测分析和重点税源监控管理工作；组织实施税收经济分析工作；运用税收数据对本地区经济运行情况开展动态监控分析；承担税收政策效应分析工作；组织实施预决算、基建、会计核算、财务内控和政府采购、固定资产等工作。

征收管理股。组织实施税收征管法律法规、规章及规范性文件；组织实施税务登记、纳税申报、普通发票管理等日常征管工作；负责征管质量监控评价；组织实施信息化建设工作；负责落实税务行业标准和业务需求管理；负责欠税工作统筹管理。

税收风险管理股。组织实施风险管理的目标规划、制度制定工作；负责本单位税收风险管理模型构建、分析识别、任务推送、监控评价结果反馈等工作；负责肇庆市税务局下发风险应对任务的整合和推送；负责组织落实风险管理工作。

税源管理一股。负责本县出口退（免）税的政策、风险、内控管理和监督工作；负责本县除提级核准管理企业以外的出口企业的出口退（免）税业务审核、调查评估、复审、报县级税务局局领导核准等具体操作；开展本县除提级核准管理企业以外的出口企业的出口退（免）税低风险任务、税费疑点任务等风险应对工作；承担市级税务局委派的约谈和实地核查初核等工作。

税源管理二股。负责所辖税源涉及的专业管理、难度较高的复杂事项，包括：肇庆重点项目税收一体化管理、土地增值税清算审核、股权转让审核、重大资产处置等事项。

组织人事股。组织实施干部人事制度及人才队伍建设；承担人事、机构编制、公务员管理、干部考核、工资、人事档案、专业技术职务管理等工作；组织实施数字人事管理工作；负责教育培训和老干部工作。

机关党委（党建工作股）。组织实施机关党建和党风廉政建设工作；统筹负责机关党员教育、管理、监督和服务工作；组织开展机关思想政治工作和精神文明建设；承担机关统战工作；协调机关工会、共青团、妇委会开展机关群团工作；组织落实扶贫工作。

根据有关规定，设置党委纪检组，负责机关和派出机构党的纪律检查工作。